Vacuum มีบทบาทสำคัญในงานการแพทย์และเภสัชกรรม ทั้งด้านการรักษาและการผลิตยา ในโรงพยาบาลมีระบบสุญญากาศกลางสำหรับดูดสารคัดหลั่ง เลือด และของเสียระหว่างการผ่าตัด เครื่องดูดเสมหะและอุปกรณ์ช่วยชีวิตหลายชนิดทำงานด้วยหลักการสร้างแรงดันต่ำ กระบวนการผลิตยาใช้สุญญากาศในการอบแห้งแบบ Freeze Dry (Lyophilization) เพื่อรักษาคุณภาพตัวยา การกรองแบบสุญญากาศช่วยแยกของแข็งออกจากของเหลวอย่างมีประสิทธิภาพ บริษัทเภสัชกรรมขนาดใหญ่ เช่น Pfizer Inc. ใช้ระบบสุญญากาศในสายการผลิตยาและวัคซีน Vacuum ยังใช้ในการบรรจุปลอดเชื้อเพื่อลดการปนเปื้อนของอากาศ โดยรวมแล้วเทคโนโลยีสุญญากาศช่วยเพิ่มความปลอดภัย ความสะอาด และมาตรฐานคุณภาพในวงการแพทย์และเภสัชกรรม

องค์ประกอบหลักของระบบสุญญากาศในงานด้านนี้ประกอบด้วย ห้องกระบวนการหรือห้องปลอดเชื้อ (Process/Isolation Chamber) ปั๊มสุญญากาศ (Vacuum Pump) ที่ออกแบบให้ปลอดน้ำมันหรือเหมาะกับงานสะอาด ระบบกรองและดักจับไอ (Filter/Trap) เพื่อป้องกันการปนเปื้อน ระบบท่อและวาล์วแบบสุขอนามัย (Sanitary Design) เครื่องมือวัดความดันและเซนเซอร์ควบคุม รวมถึงระบบควบคุมอัตโนมัติที่สามารถบันทึกข้อมูลตามมาตรฐานอุตสาหกรรมยา

หลักการทำงานเริ่มจากการลดความดันภายในห้องกระบวนการให้ได้ระดับที่กำหนด เช่น ในการทำ Freeze Dry จะลดความดันเพื่อให้น้ำแข็งระเหิดโดยไม่ผ่านสถานะของเหลว ช่วยรักษาโครงสร้างตัวยา ในระบบดูดทางการแพทย์ ปั๊มสุญญากาศจะสร้างแรงดูดเพื่อนำของเหลวหรือสารคัดหลั่งออกอย่างปลอดภัย การควบคุมแรงดันอย่างแม่นยำช่วยให้กระบวนการมีความเสถียรและเป็นไปตามมาตรฐานคุณภาพ